Το Χειρουργικό Τμήμα του Ασκληπιείου Κρήτης περιλαμβάνει Γενική Χειρουργική, Ορθοπεδική, Οφθαλμολογική, Ω.Ρ.Λ.
Η σύγχρονη κλινική και χειρουργική αντιμετώπιση για όλο το φάσμα των χειρουργικών επεμβάσεων επιτελείται από εξειδικευμένη ομάδα ιατρών, άριστα εκπαιδευμένους και με πολυετή εμπειρία.
Η χειρουργική ομάδα του Ασκληπιείου Κρήτης με τη χρήση των πιο σύγχρονων ιατρικών μηχανημάτων (DOPPLER, TRIPLEX, Yπερήχων, Λαπαροσκόπιο, Ενδοσκόπιο, Laser) αναλαμβάνει προληπτική χειρουργική εξέταση, όλες τις επεμβάσεις που εκτελούνται τόσο με τις κλασσικές όσο και με τις σύγχρονες μεθόδους της χειρουργικής όπως η λαπαροσκοπική μέθοδος, ο ενδοσκοπικός έλεγχος και η ενδοσκοπική χειρουργική.