Στο Παθολογικό Τμήμα του Ασκληπιείου Κρήτης λειτουργούν εκτός του Παθολογικού ιατρείου, Διαβητολογικό εργαστήριο και Γαστρεντερολογικό ιατρείο.
Το Παθολογικό Τμήμα του Ασκληπιείου Κρήτης είναι άρτια οργανωμένο και στελεχωμένο με επιστημονικά διακεκριμένο προσωπικό. Διαθέτει Διαγνωστικές Μονάδες για την παρακολούθηση του Σακχαρώδη διαβήτη, Εργαστήριο Υπερηχογραφήματος 2 διαστάσεων και έγχρωμου Doppler και εργαστήριο Ενδοσκοπήσεων ανωτέρου και κατωτέρου πεπτικού συστήματος.